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技術文獻

試驗中抗體該如何選擇?
閱讀次數(shù):1215 發(fā)布時間:2021/5/11 9:50:34
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當您選擇抗體時,些有用的建議如下:

通過查閱文獻,查找使用過類似抗體的實驗室進行咨詢;

詢問其他實驗室成員是否已經(jīng)用過了適合您實驗的抗體;

檢查抗體的克隆性、應用適應性、宿主物種和種屬反應性等各種數(shù)據(jù)。

查看供應商提供的圖片和數(shù)據(jù)——數(shù)據(jù)是否可信、實驗結果優(yōu)劣鑒定?

參考引用該抗體的任何論文和論文中數(shù)據(jù)的表現(xiàn)選擇適合自己的抗體。

抗選擇

01 確認研究用途

研究主題是什么?

抗體的克隆性質(zhì)?

02 抗體的種屬?

樣本的種屬來源需要和抗體的種屬來源不同。像western blot這樣的實驗應用,樣本是沒有內(nèi)源性免疫球蛋白(IgG)的細胞裂解液,或者使用直標抗的實驗應用,都不用擔心這個問題。

如果不得不需要使用和樣本種屬來源相同的抗體 (如鼠抗鼠的抗體),建議進行抗體定制服務。

03 非模式生物

如果研究對象為非模式生物,并且不得不要用種在該物種中沒有被測試過的抗體。當然很可能無法得到理想的結果,但是大部分的保守序列蛋白質(zhì)是可以被個未經(jīng)驗證的抗體識別的。

因此,如果沒有很好地選擇,般建議選擇對目標生物的該蛋白進行序列比對,并且得出該蛋白序列是否足夠保守的結果。(Swiss-Prot蛋白數(shù)據(jù)庫鏈接中可以找到所需的序列,還有些網(wǎng)站提供計算相似度的工具,例如多序列比對工具CLUSTALW.)

將抗體的免疫原序列與您想檢測的物種的蛋白序列進行比對,如果重合比對結果重復度大于85%,那么兩者可能會發(fā)生交叉反應效應(即使是比對得分大于85%,也無法完全保證抗體定會識別)需要使用多個對照來確定該抗體是按您預期與靶標特異地結合。

關于二抗選取的幾個建議:

選擇蕞亮的熒光素來標記表達量蕞低的蛋白質(zhì)

當您使用多色標記時,所有二抗應該保持物種來源致

如果您在實驗用來自和二抗同宿主物種的血清來封閉樣本,這將顯著降低背景

預吸附二抗 對于多色分析很有用,可確保較低的物種間交叉反應性

片段抗體 更小且可高效得滲入組織(對IHC很有用)

生物素偶聯(lián)物可檢測低豐度蛋白

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